長年、わが国の健康を支えてきた伝統食品である「納豆」。この納豆のネバネバ部分に含まれるタンパク質分解酵素がナットウキナーゼです。 納豆は、煮大豆を納豆菌が発酵させることでできる食品ですが、この発酵過程でナットウキナーゼをはじめとする多様な栄養素が生成されます。1925年、北海道帝国大学の大島先生によりその精製および性質について報告がなされており、その後様々な研究報告がなされ、1980年代にフィブリン（血栓の素となるタンパク質）を分解（溶解）する酵素が「ナットウキナーゼ」として命名されました。

ナットウキナーゼには、血栓の主成分であるフィブリンに直接働きかけ分解（溶解）する作用、身体の中の血栓溶解酵素であるウロキナーゼの前駆体プロウロキナーゼを活性化する作用、さらに血栓溶解酵素プラスミンを作り出す組織プラスミノーゲンアクチベーター（t-PA）量を増大させる作用があります。
さらに、最近の研究で、ナットウキナーゼには血栓を溶けにくくする血栓溶解阻害物質PAI-1を分解する作用、オイグロブリン溶解時間の短縮作用があり、血栓溶解活性の増強作用があることがわかってきました。

上記の通り、ナットウキナーゼには直接、また間接的に血栓を溶解する機能が確認されていますが、これは、血栓により滞っていた血管内の血流を改善することに繋がります。特に高齢者の方の血管は、若年者の血管に比べて形態学的にも機能的にも大きく異なり、その中で、血流が加齢により低下することが報告されています。ナットウキナーゼには血流を改善する機能がヒト試験により確認されており、こういった加齢による影響を軽減する可能性があります。さらに、血流を改善することで、血圧降下作用や末梢体温を維持する機能性が同じくヒト試験によって確認されており、ナットウキナーゼの持つ作用の中でも非常に重要なものとなります。

※協会が推奨している原料は日本の機能性表示食品に対応しています。

食品としての納豆には、血栓溶解を促す成分「ナットウキナーゼ」が含まれている反面、血液凝固を促進する「ビタミンK₂」も含まれています。そのため、ビタミンK₂の除去されたナットウキナーゼの方が、納豆に比べ優れた血栓溶解作用を持っています。 また、血栓症患者などに処方される血液を固まりにくくする医薬品、「ワルファリン（商品名：ワーファリン等）」を服用されている方は、「ビタミンK₂の拮抗作用」により効果が減弱されるため、納豆などのビタミンK₂を多く含む食品の摂取は医師により制限されています。そのため、折角の納豆の血栓溶解作用を活かすことが出来ませんでした。しかし、ナットウキナーゼならその様な方でも安心して摂取することが可能です。